● 對于非變性凝膠電泳,Marker是否需要DNA變性?
答:本公司Marker產(chǎn)品中只有Lambda DNA Marker為質(zhì)粒酶切產(chǎn)物,在電泳上樣前如加熱處理可獲得最佳效果,其余產(chǎn)品均不需點樣前加熱處理;另外電壓太高也會使凝膠過熱和DNA變性造成帶型異常。
● 當(dāng)DNA停留在凝膠點樣孔處時該怎么辦?
答:檢查膠濃度是否在適合分離DNA片段的范圍,點樣孔是否高質(zhì),確保電泳的正負(fù)極正確,檢查電泳緩沖液是否具有緩沖能力,確保DNA樣品的純度,如進(jìn)行PCR產(chǎn)物的純化,確保樣本中沒有或只存在少量的DNA結(jié)合蛋白或其他可與DNA結(jié)合的化合物。
● 為什么DNA條帶不理想?
答:影響電泳條帶的因素很多,如凝膠種類濃度質(zhì)量;上樣量過多或過少;樣本的純度不高,鹽濃度過高;電泳緩沖液緩沖能力不夠,核酸酶污染;電泳條件不正確;染色不充分或不均勻;跑膠后沒有及時拍照。
● 為什么定量數(shù)據(jù)不正確以及如何準(zhǔn)確定量樣品?
答:樣品和Marker的上樣條件不同,參考條帶不正確,凝膠的不均勻染色或背景過高都會干擾凝膠定量結(jié)果。樣品DNA和Marker DNA在電泳前選用相同的上樣染料處理,調(diào)整樣品濃度,使其在凝膠中的含量與分子量最接近標(biāo)準(zhǔn)DNA條帶接近,樣品DNA和Marker的上樣體積盡量接近,樣品用1×上樣緩沖液稀釋;定量時通常以分子量最接近的標(biāo)準(zhǔn)條帶為參照物,分析樣品條帶的含量;利用凝膠圖像分析軟件,如SensiAnsys可對DNA進(jìn)行準(zhǔn)確定量,比目測條帶方法更精確。
● 為什么在變性聚丙烯酰胺/尿素凝膠里電泳時會出現(xiàn)雜帶?
答:一般來說,雙鏈DNA Marker不推薦用于變性電泳,否則會產(chǎn)生非正常帶型,即出現(xiàn)所謂的雜帶。這種出現(xiàn)異型帶的現(xiàn)象,在100 bp以下的條帶極易發(fā)生。當(dāng)您的實驗不可避免的要使用變性聚丙烯酰胺/尿素凝膠進(jìn)行電泳時,我們建議,將樣品和Marker選用同樣的變性上樣緩沖液進(jìn)行變性處理后上樣,以消除二級結(jié)構(gòu)。