RT-PCR Kit(逆轉錄試劑盒)
產品說明
RT-PCR Kit(逆轉錄試劑盒)是專為兩步法RT-PCR第一步實驗配制的、具有高靈敏度的RT-PCR反應系統。該系統合理配備了與cDNA第一鏈合成反應相關的各種組分,優化的體系保證了M-MLV具有高效的逆轉錄酶活性,所得cDNA對后續的PCR或定量PCR實驗兼容性好,可用于檢測稀有基因的表達、從極少數細胞中定量檢測特定mRNA的表達水平、克隆特定基因的cDNA片段等。
M-MLV逆轉錄酶是由一個71 kD的單亞基組成的重組型DNA逆轉錄聚合酶。可以催化以RNA或DNA:RNA雜交鏈為模板的互補DNA 的聚合反應。本酶經修飾RNase H活性比普通的逆轉錄酶要弱很多,因此在合成第一鏈cDNA的過程中,可保證RNA的降解程度較低,從而使得率提高。
產品組分
貨號 | R1011(20次) | R1012(100次) |
M-MLV(200U/μl) | 20 μl | 100 μl |
RNasin(40U/μl) | 12 μl | 60 μl |
Oligo d(T)15 Primer(50 μM) | 20 μl | 100 μl |
Random primer(50 μM) | 20 μl | 100 μl |
5xfirst-strand buffer | 80 μl | 400 μl |
RNase-free ddH2O | 1 ml | 1 ml×5 |
dNTPs(10mM each) | 50 μl | 250 μl |
R1011可進行20次逆轉錄反應,R1012可進行100次逆轉錄反應(20 μl 標準PCR反應體系,每次使用 M-MLV 1μl)。
M-MLV 儲存液
20 mM Tris-HCl (pH 7.5)
200 mM NaCl
0.1 mM EDTA
1 mM DTT
0.01% NP-40
50% glycerol
5xfirst-strand buffer 成分
250 mM Tris-HCl (pH 8.3 at 25℃)
375 mM KCl
15 mM MgCl2
50 mM DTT
質量檢測
逆轉錄酶活性檢測
使用[32P]dCTP作為標記,200 U的 M-MLV以1μg、1.2 kb的RNA為模板進逆轉錄反應,最低可得到120ng的cDNA,所得cDNA長度 > 全長的90%。
核酸外切酶活性檢測
混合50ng的標記DNA 或RNA與200U M-MLV在1×反應緩沖液體系中,37℃溫浴1 h,檢測DNA和RNA降解都不到總量的1%。
適用范圍
第一鏈cDNA 合成
cDNA文庫構建
RT-PCR
引物延伸
3'和5' RACE
注意事項
l 成功的cDNA合成來自高質量的RNA。高質量的RNA至少應保證全長的完整性并且不含逆轉錄酶的抑制劑,如EDTA或 SDS。用于cDNA合成反應的溶液試劑盡可能用DEPC進行處理,并在高壓滅菌后使用。有些試劑不能用高壓滅菌處理時,首先用經過滅菌的器具、水等配制溶液后,再將溶液進行過濾除菌處理。
l 為了增加貯存RNA樣品的穩定性,可以將RNA溶解在去離子的甲酰胺中,存于-70℃。用于保存 RNA 的甲酰胺一定不能含有降解RNA的雜物。來源于胰臟的RNA至少可以在甲酰胺中保存一年。當準備使用RNA時,可以使用下列方法沉淀RNA:加入NaCl至0.2 M同時加入4倍體積的乙醇,室溫放置3-5 min,10,000 rpm離心5 min。
l 在逆轉錄反應中經常加入RNase抑制劑(RNasin)以增加cDNA合成的長度和產量。在第一鏈合成反應中,RNase抑制劑在緩沖液和還原劑(如 DTT)存在的條件下加入,因為cDNA合成前的過程會使抑制劑變性,從而釋放出RNase。但是RNase抑制劑僅防止RNase A,B,C 對RNA的降解,并不能防止皮膚上的RNase,因此盡管使用了RNase抑制劑,也要小心不要從手指上引入RNase。
l 較高的保溫溫度有助于RNA二級結構的打開,增加反應的產量。
l 使用簡單的RNA純化方法即可獲得滿足RT-PCR反應的RNA,但為了保證實驗的成功率,建議使用GTC法(異硫氰酸胍法)制備的高純度RNA。
l 為防止RNA降解,應盡量避免反復凍融,最好保存于-70℃。
l 最佳的PCR反應條件,因PCR擴增儀的不同而不同,所以在使用您的樣品之前最好先試做一下control反應,以確定最佳的PCR反應條件。
l cDNA產物應置于-20℃保存。
l 當以cDNA為模板進行PCR之前,使用RNase H處理cDNA,可以提高PCR反應的靈敏度。
操作步驟
1 在冰浴的無菌離心管中配制下列混合物
1-5μg RNA
1μl Oligo(dT)15 或Random primer,
補RNase-free ddH2O至13.4μl;
2進行變性退火反應
70℃溫浴5 min,
簡短離心后冰浴5 min;
3在上述離心管中配制反轉錄反應液
4 μl 5×first-strand buffer
1 μl dNTPs(10 mM each)
0.6μl RNasin ,
1 μl M-MLV;
4按下列條件進行反轉錄反應
Oligo (dT)15 :42℃溫浴60 min;
Random primer: 37℃溫浴60 min。
5終止反應
70℃溫浴5 min終止反應,置冰上進行后續實驗或-20℃保存。
6用RNase-free ddH2O將反應體系稀釋到50μl,取2-5μl進行PCR擴增反應。