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技術分享丨突破花生育種瓶頸,KASP技術助力精準分子標記輔助育種

欄目:技術分享 發(fā)布時間:2024-07-04
在現代農業(yè)科技的浪潮中,分子標記輔助育種技術已成為提升作物產量和品質的重要手段。KASP(Kompetitive Allele Specific PCR,競爭性等位基因特異性PCR)技術正是這一領域的創(chuàng)新突破,特別是在農作物育種上的應用,為科研工作者和育種專家提供了強有力的工具。


應用分享
今天分享一篇利用KASP標記輔助分子育種的文章,這篇論文的主要內容是關于花生的遺傳研究,特別是針對提高花生產量的三個關鍵數量性狀:100粒莢重(HPW)、100粒籽重(HSW)和脫殼率(SP)。

研究背景:花生作為一種重要的農作物,其產量的提升對于全球食品供應具有重要意義。HPW、HSW和SP是影響花生產量的三個主要因素。

實驗材料:

  • 使用了重組近交系(RILs)群體,這些RILs源自“Silihong”(A. hypogaea var. fastigiate)和“Jinonghei 3”(A. hypogaea var. hypogaea)的雜交。

  • 利用美國小核心種質集合作為關聯(lián)分析的群體。

實驗方案:

  1. 高密度遺傳連鎖圖譜構建:通過重新測序RILs,構建了一個包含4499個箱(bins)的高密度遺傳連鎖圖譜,覆蓋20條染色體,總長度為1712.32 cM。

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2. 數量性狀位點(QTL)分析:在三個不同的環(huán)境下,共鑒定出46個與HPW、HSW和SP相關的QTLs。其中,一些主要QTLs如qHPW5.2、qSP7.1和qSP18.2等,顯示出較高的表型變異解釋率(PVE)。

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3. 全基因組關聯(lián)研究(GWAS):使用美國小核心種質集合進行GWAS,以驗證QTL定位的準確性,并在兩個環(huán)境中鑒定出與HPW、HSW和SP顯著相關的115個單核苷酸多態(tài)性(SNPs)。

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4. KASP標記開發(fā)與驗證:基于QTL區(qū)域,開發(fā)了三個KASP標記,并在花生品種和地方品種中進行了驗證,這些標記與HPW、HSW和SP有顯著關聯(lián)。

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上圖展示了KASP-SP7標記對花生小組中SP、HPW和HSW的影響。包括統(tǒng)計圖表顯示KASP-SP7不同等位基因對目標性狀的影響,并用星號表示顯著性水平。


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上圖展示了KASP-SP18和KASP-HPW5標記在花生小組中的驗證效果。包括兩個子圖,A展示KASP-SP18對SP的影響,B展示KASP-HPW5對HPW的影響,同樣使用統(tǒng)計圖表和顯著性標記。

研究結果:

  • 確定了多個與HPW、HSW和SP相關的QTLs和SNPs,其中一些是首次發(fā)現。

  • 通過GWAS驗證了QTL定位的準確性,并且發(fā)現了一些QTLs和SNPs的共定位。

  • 開發(fā)的KASP標記為花生分子輔助育種提供了有用的工具。

結論:本研究不僅為理解花生HPW、HSW和SP的遺傳基礎提供了新的見解,而且開發(fā)的KASP標記有助于加速花生的分子輔助育種進程。

原文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.jia.2024.06.013

KASP技術的優(yōu)勢

高效率:KASP技術能夠大幅縮短育種周期,提高育種效率。
高精準度:基于SNP的分子標記技術保證了篩選的準確性。
高通用性:KASP技術適用于多種作物的分子標記輔助育種。
操作簡便:簡化了實驗操作流程,易于在不同實驗室推廣使用。

隨著分子生物學技術的不斷進步,KASP技術將在現代農業(yè)發(fā)展中扮演越來越重要的角色。東盛生物致力于推動生物科技在農業(yè)領域的應用,KASP試劑的推出是我們對創(chuàng)新和精準農業(yè)的承諾。我們期待與廣大科研工作者和育種專家攜手合作,共同開啟農業(yè)科技的新篇章。


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